Amazonin niinkuin minkä tahansa muunkin biomin nettovaikutus ilman happipitoisuuteen on melkolailla nolla. Ilmakehän nykyinen happipitoisuus on kumuloitunut vuosimiljardien aikana meren kasviplanktonin toimesta. Osa kasviplanktonista ehtii hautautua merenpohjaan ennenkuin sillä on mahdollisuutta mädäntyä ja kuluttaa vapauttamaansa happea mikrobien hajottamisen tuloksena.

Amazon kyllä vastaa n. 20% maalla tapahtuvasta fotosynteesista, joten siitä ehkä tuo epämääräinen ilmaus peräisin. Amazon on valtava hiilivarasto ja biodiversiteetiltään rikkain ekosysteemi. Lisäksi sillä on suuri vaikutus sateiden syntymiseen alueella ja siten veden kiertokulkuun.